Comment faire une analyse de selles

En France, environ 24% des prélèvements de selles pour coproculture sont jugés non conformes par les laboratoires, souvent en raison d'une mauvaise procédure de recueil. L'analyse de selles, ou coproculture, est un examen médical essentiel prescrit pour diagnostiquer les infections digestives bactériennes, parasitaires ou virales. Elle permet d'identifier les agents pathogènes responsables de diarrhées persistantes, douleurs abdominales ou troubles intestinaux. Réaliser correctement ce prélèvement garantit la fiabilité des résultats et un diagnostic précis.

Les étapes à suivre

Étape 1 : Récupérer le matériel de prélèvement au laboratoire

Avant de réaliser votre prélèvement, rendez-vous dans un laboratoire d'analyses médicales avec votre ordonnance pour obtenir le kit de prélèvement stérile. Ce kit contient généralement un pot stérile avec spatule intégrée, un sachet hermétique de transport et une fiche de renseignements à compléter. Les laboratoires comme ELSAN, Cerballiance ou Biogroup fournissent gratuitement ce matériel. Profitez de cette visite pour poser vos questions au personnel et obtenir des instructions personnalisées selon le type d'analyse prescrite : coproculture standard, recherche de parasites ou examen parasitologique des selles (EPS). N'oubliez pas de demander si votre analyse nécessite des prélèvements multiples, car pour la parasitologie, il est souvent recommandé de réaliser 3 prélèvements sur 3 jours différents espacés de 2 à 3 jours.

Étape 2 : Préparer le prélèvement correctement

Dans les 3 jours précédant le prélèvement, adoptez un régime pauvre en résidus en évitant les aliments laissant beaucoup de fibres : légumes secs, choux, salades cuites, oseilles, fraises, figues et poires. Il est essentiel de réaliser le prélèvement à distance de tout traitement antibiotique (au minimum 2 jours après l'arrêt) et d'éviter les laxatifs, suppositoires ou charbon. Ne faites pas le prélèvement après un examen radiographique avec produits opaques. Si possible, effectuez le prélèvement lors d'un épisode diarrhéique pour optimiser la détection des agents pathogènes. Selon les recommandations de la Société Française de Microbiologie, le prélèvement avant traitement améliore significativement la sensibilité de l'examen. Si vous prenez des antibiotiques, signalez-le obligatoirement au laboratoire car cela peut fausser les résultats.

Étape 3 : Recueillir l'échantillon de selles

Pour recueillir vos selles, placez un dispositif de recueil propre (champ fourni dans le kit ou sac plastique propre) sur la cuvette des toilettes pour éviter que les selles ne touchent l'eau ou l'intérieur des toilettes, ce qui les contaminerait. Si vous devez uriner, faites-le avant d'installer le dispositif car l'urine peut altérer l'analyse. Une fois les selles émises, utilisez immédiatement la spatule stérile fournie pour prélever l'équivalent d'une noix de matières fécales et transférez-les dans le pot stérile. Privilégiez les parties sanglantes, gluantes ou liquides si présentes. Remplissez le pot au minimum à un quart et au maximum à la moitié. Il est inutile de remplir le pot à ras bord. Chez les nourrissons, raclez un maximum de matières fécales directement sur la couche avec la spatule fournie.

Étape 4 : Identifier et conditionner l'échantillon

Après avoir prélevé les selles, fermez hermétiquement le pot stérile en vissant bien le couvercle pour assurer son étanchéité. Identifiez clairement le pot en inscrivant vos nom, prénom, date de naissance directement sur l'étiquette prévue ou sur le pot lui-même. Notez impérativement la date et l'heure exacte du recueil, car ces informations sont essentielles pour l'interprétation des résultats par le biologiste. Remplissez minutieusement la fiche de renseignements cliniques fournie avec le matériel : précisez vos symptômes, la durée de la diarrhée, tout voyage récent à l'étranger, vos traitements en cours et le contexte clinique. Placez le pot dans le sac plastique hermétique fourni, puis glissez la fiche et votre ordonnance dans la poche prévue à cet effet.

Étape 5 : Transporter l'échantillon au laboratoire

Le délai de transport est crucial pour la fiabilité de l'analyse. Idéalement, apportez votre échantillon au laboratoire dans les 2 heures maximum suivant le recueil pour une coproculture standard, et dans les 3 heures pour une recherche parasitologique. Selon les laboratoires Bio-Val et ELSAN, la durée de conservation maximale d'une coproculture est de 24 heures. Si vous ne pouvez pas vous rendre immédiatement au laboratoire, conservez l'échantillon au réfrigérateur à 4°C dans son sac hermétique. Ne congelez jamais l'échantillon sauf indication contraire spécifique. Pour la recherche d'amibes ou de Clostridium difficile, le prélèvement doit parfois être effectué directement au laboratoire. Les résultats sont généralement disponibles entre 24 et 72 heures selon le type d'analyse demandée.

💡 Conseils et astuces

• Lavez-vous soigneusement les mains avant et après la collecte des selles pour éviter toute contamination croisée
• Évitez de prélever les selles qui ont touché l'eau de la cuvette des toilettes, car elles seraient contaminées par des germes
• Pour les examens parasitologiques, répétez l'examen 3 fois sur une période de 10 jours pour améliorer significativement la sensibilité de détection
• En cas de constipation, d'hémorroïdes sanglantes ou de menstruation, reportez si possible le prélèvement pour éviter les faux positifs
• Conservez toujours l'échantillon dans son sac hermétique au réfrigérateur et jamais à température ambiante au-delà de 2 heures
• Le coût d'une coproculture standard en France est d'environ 15 à 20 euros, pris en charge à 60% par l'Assurance Maladie sur prescription médicale