Mayotte : le chikungunya reflue, paludisme et Mpox persistent en juin 2026

Le chikungunya perd du terrain

Après plusieurs mois de circulation soutenue, le chikungunya marque un repli à Mayotte. Selon les données relayées par Le Mahorais dans son point sanitaire du 14 juin, les signalements SAMU ont baissé et les consultations se stabilisent. Entre la semaine 21 et la semaine 22, les nouveaux cas sont passés de 25 à 13, soit une chute de 48 %, selon mesvaccins.net.

Le cumul 2026 reste élevé : 1 291 cas enregistrés à une date intermédiaire. Cette circulation avait repris après la fin officielle de l’épidémie de 2025, qui avait elle-même dépassé 1 200 cas selon l’ANRS. La baisse actuelle est décrite comme une tendance de fond depuis quatre semaines, sans que l’épidémie soit déclarée terminée.

Paludisme : un foyer ancré à Chirongui

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C’est le signal le plus préoccupant du bulletin SPF du 5 juin 2026. Sur 212 cas cumulés depuis janvier, 70 sont des cas locaux suspects et 129 des cas importés, principalement depuis les Comores. Les 13 cas indéterminés complètent le décompte.

La semaine 22 a enregistré 15 nouveaux cas, dont 13 à transmission locale. Le foyer de Chirongui, dans le sud de l’île, concentre 38 des 71 cas locaux cumulés, selon les données croisées entre SPF et les médias locaux. La commune représente à elle seule environ 53 % des cas autochtones de l’île.

La situation préoccupe suffisamment les autorités sanitaires américaines pour que les CDC (Centers for Disease Control and Prevention) maintiennent une alerte de niveau 2 sur le paludisme à Mayotte, mise à jour le 2 juin 2026. Le niveau 2 signifie une transmission active sur l’ensemble du territoire insulaire. La route migratoire entre Mayotte et les Comores, empruntée par près de 14 000 passagers en six mois selon l’OIM, entretient le flux de cas importés.

Mpox : la transmission locale s’installe

Le premier cas de Mpox à Mayotte avait été confirmé le 8 janvier 2026 par l’ARS Mayotte : un cas importé de Madagascar, de clade Ib. Depuis, la situation a évolué. Au 5 juin, le bulletin SPF recense 31 cas cumulés : 18 autochtones et 13 importés.

La dynamique s’est accélérée fin avril. Semaine 20 : 7 cas. Semaine 21 : 5 cas. Les importations répétées depuis Madagascar alimentent des chaînes de transmission locale, selon Santé publique France. La circulation autochtone est désormais établie.

La 1ère Franceinfo et Linfo.re signalent que cette hausse simultanée du paludisme local et du Mpox constitue une pression accrue sur le système de santé mahorais, déjà sollicité par le chikungunya en début d’année.

Contexte dans le département

Mayotte cumule des facteurs qui compliquent la surveillance épidémiologique. La densité de population, la présence de gîtes larvaires liés à l’habitat informel, et les flux réguliers avec les Comores et Madagascar créent un environnement favorable à la circulation de pathogènes vectoriels et viraux. Les fragilités sociales dans certains quartiers rendent également l’accès aux soins inégal.

Pour le paludisme, la situation de 2026 marque une rupture avec les périodes récentes sans transmission autochtone significative. Les 70 cas locaux suspects cumulés à mi-juin représentent un niveau inédit depuis plusieurs années, selon SPF. Le territoire avait connu des épisodes similaires dans les années 2010, mais la résurgence actuelle s’accompagne d’un foyer géographiquement délimité - Chirongui - ce qui facilite la réponse de terrain.

L’ARS Mayotte et SPF maintiennent une surveillance hebdomadaire. Des mesures de lutte anti-vectorielle renforcées sont en cours localement, notamment à Chirongui, selon le bulletin du 5 juin. Les chantiers d’infrastructure en cours sur l’île, comme l’usine de dessalement d’Ironi Bé, génèrent par ailleurs des points d’eau susceptibles de constituer des gîtes larvaires supplémentaires si non maîtrisés.

Prochaines étapes

Le prochain bulletin hebdomadaire SPF/ARS Mayotte est attendu autour du 12 juin 2026 pour les données de semaine 23. Les autorités sanitaires suivent en particulier l’évolution du foyer de Chirongui et la dynamique du Mpox, dont la transmission autochtone reste active selon les dernières données disponibles.